利用药物来治疗甲亢，通常适用于甲亢初期的治疗。但是疗程会比较长，需要12个月～18个月，并且停药以后复发率会比较高。而且抗甲状腺药物的副作用也比较多。
有白细胞减少、全身的皮疹、肝肾功能损害，这些都是抗甲状腺药物治疗的副作用。但是不是每一个人都会有这样的副作用，因人而异的。131碘治疗甲亢目前也广泛应用于临床。
它治疗甲亢安全有效，没有抗甲状腺药物那么多的副作用和疗程长的缺点。同时也避免了一些手术治疗的并发症。通常131碘治疗甲亢，一次性的治愈率比较高复发率很低。但是孕妇、哺乳期妇女和打算半年内要怀孕的人群，尽量避免使用131碘来治疗甲亢。