流行性腮腺炎和化脓性腮腺炎的区别如下：
第一，病原菌区别。流行性腮腺炎主要是由病毒感染引起，化脓性腮腺炎主要是由细菌感染引起。
第二，临床表现区别。流行性腮腺炎多呈双侧受累，腮腺肿大但不红，疼痛症状相对较轻，发热症状明显，体温高达38度以上，属于呼吸道传染病。化脓性腮腺炎常表现出一侧腮腺肿大、发红，疼痛症状明显，病情发展到晚期会出现波动感，属于感染性疾病。
第三，实验室检查区别。流行性腮腺炎的全血常规检查呈现淋巴细胞增高，化脓性腮腺炎呈现白细胞和中性粒细胞增高。