消化道穿孔需要手术治疗，同时也需要抗感染对症药物治疗。
消化道穿孔临床表现为腹部突发剧烈疼痛，呈刀绞疼痛，可以很快发生全腹部的化脓性腹膜炎，并伴脓毒素血症、高热、寒战等症状以及血压下降迅速出现休克。通过X线腹部立卧位片检查，可见膈下游离气体、腹腔积液。由此可见消化道穿孔不仅需要手术治疗，也需要抗生素、血管活性药物进行药物治疗。
一旦诊断明确需要立即手术治疗，胃十二指肠溃疡穿孔、小肠穿孔均需要修补手术。而结肠穿孔，常需要一期结肠造口后再二期还纳。