肛乳头瘤会恶变。肛乳头是人体正常的解剖组织，它是存在于肛隐窝开口处的乳头状的小凸起，本身个头很小，肉眼难以观察，大约有十几个。
当肛乳头受到物理摩擦、辛辣等刺激、炎症刺激等，会逐渐肥大增生。直径在0.5公分以下者，通常称之为肛乳头肥大，直径超过0.5公分者，脱出肛门外，称之为肛乳头瘤。
当肛乳头瘤继续受到物理摩擦、炎症、辛辣或其它刺激时，会发生恶变，演变成直肠癌。当然，这个过程需要很长的时间才有可能出现，发生的概率也很低。