甲状腺囊肿形成的机制目前尚未明确，有可能是甲状腺结节或甲状腺瘤发生退变引起的。
大多数甲状腺囊肿属于是良性的，一般也不会出现有明显的症状，只是在触摸时发现有凸起的囊状物。如果较大的囊肿，有可能会压迫周边的组织，这时就会引起局部疼痛、呼吸不畅，甚至引起吞咽困难、声音嘶哑。
如果较小的囊肿，没有任何症状，也可以不用特殊治疗，定期复查，密切观察即可，属于是良性的症状。不严重的甲状腺囊肿也可以通过用细针抽吸硬化治疗，但比较大的囊肿则需要做手术切除。