在了解尿道综合症的病因之前，我们先来看看什么是尿道综合症。尿道综合征，是指有尿频、尿急、尿痛等症状，但膀胱和尿的检查有明显的器质性病变的一组非特异性症候群。在已婚的中青年女性中较为多见。目前临床上分析，可能引起尿道综合症的病因，有以下一些。
第一，泌尿系统的感染，患者尿道口组织的病理改变均为慢性炎症反应，多数患者尿培养可能阳性，厌氧菌培养可增加阳性发现。
第二，尿道梗阻，比如膀胱颈梗阻、尿道远端周围组织纤维化或括约肌痉挛而导致远端尿道缩窄。
第三，尿道外口解剖异常，如尿道处女膜融合、处女膜伞、小阴唇融合等。
第四神经功能异常，损伤、感染、x线照射等引起尿道内纤维组织增生，使神经发生异常反射。
第五，心理因素，比如紧张焦虑的情绪、多疑及内向等心理状态是尿道综合症的易感因素。其他还有比如，免疫因素、激素水平的改变、微量元素的缺乏、医源性等等。