口腔真菌感染是指真菌感染引起口腔黏膜疾病，口腔念珠菌病是最常见的，针对念珠菌用药如下，局部的药物包括碳酸氢钠、制霉菌素、米糠唑。全身抗真菌药物治疗包括铜康唑、氟康唑、伊曲康唑，同时还需要增强机体的免疫力，比如注射胸腺肽，转移因子。
当上述治疗疗效不明显或者患者不能耐受药物治疗者，可以考虑手术切除。真菌感染，需要预防避免交叉感染，尤其是婴幼儿的护理。
长期使用抗生素或免疫抑制剂的病人或者是患有慢性消耗性疾病的患者，应该警惕念珠菌感染的发生，特别是注意不容易被发现的深部内脏白色念珠菌并发症的发生。