窦性心律失常是否有并发症，关键是看窦性心律失常的类型和程度。
一般情况下窦性心动过速、窦性心律不齐、轻度的窦性心动过缓，一般没有并发症，这些窦性心律失常，可以按正常对待，对心脏的射血和功能没有影响，不需要担心。但是严重的窦性心动过缓可以出现并发症，特别是心室率不足每分钟50次以上，患者会出现全身组织器官供血不足的表现，像心脏的供血不足有可能出现心绞痛发作，脑血管的供血不足，可能会出现头痛、头晕等脑缺血的症状。
严重的心动过缓甚至可以导致阿-斯综合征发作，引起患者突然晕厥、肢体抽搐，甚至心脏骤停，危及患者的生命。所以，对严重的窦性心动过缓，需要查明原因，积极采取措施，进行治疗。