腺病毒载体疫苗与临床上绝大多数的疫苗相同，都是有副作用的，但整体的安全性非常高。
接种之后可能会出现轻微的肌肉酸痛、头晕、恶心、头痛、发热等症状，针眼部位也有可能会表现为硬结、疼痛，但大多都在机体所能承受的范围之内，所以无需特殊治疗，通常都能够自行恢复。而且该疫苗比较简便快捷，只需要接种一针就能够完成全部免疫程序。
接种之后要避免受风着凉，多加休息，多饮用一些温开水，出现发热症状时，可以适当通过物理降温对症处理。如果出现发热并且持续不退热的情况，需要尽快就诊，这种情况也不排除是其他病因引起的，所以需要尽快治疗，防止耽误病情。