多囊性卵巢囊肿治疗，需要根据囊肿的性质、囊肿的体积和症状等来做决定。
有多囊性卵巢囊肿，需要积极做卵巢肿瘤标志物检查、做彩超复查，也有的需要做盆腔CT检查，帮助判断卵巢囊肿的性质。如果考虑卵巢囊肿体积比较小，有可能是生理性的，暂时可以不做治疗，可以在以后月经后做复查，有的囊肿会自动消失。
如果卵巢囊肿体积比较大，或者是长期存在，或者生长速度比较快，或者是抽血检查的结果不满意，有恶变的可能或者本身就是恶性，或者有的会发生扭转、破裂等情况，就要尽早考虑手术治疗。