附件囊肿包括输卵管囊肿和卵巢囊肿，卵巢囊肿只是附件囊肿的一种，因为女性附件包括输卵管和卵巢。
女性输卵管囊肿，一般是病理性囊肿，大多数因为患有慢性输卵管炎症引起。卵巢囊肿包括生理性卵巢囊肿和病理性卵巢囊肿两种，生理性卵巢囊肿指卵泡或者黄体囊肿。
生理性卵巢囊肿一般不需要特殊处理，等月经结束后会自然消失或者明显缩小。病理性卵巢囊肿，包括卵巢畸胎瘤和巧克力囊肿等，大多数是良性。如果比较小、直径小于5cm，而且没有明显临床症状，也不需要特殊处理。