治疗肛裂以外用药物为主，外用药膏有硝酸甘油软膏、马应龙麝香痔疮膏、红霉素软膏等，栓剂有太宁栓、肛泰栓等，这些药物具有缓解内括约肌痉挛、消炎、消肿、止痛的作用。熏洗药物有高锰酸钾，具有消炎杀菌的作用，还有中草药，具有清热燥湿的作用。
如果伴有便秘，可口服缓泻剂乳果糖或聚乙二醇，肛门疼痛剧烈者，可适当口服止痛药物。
肛裂患者在应用药物治疗的同时，平时饮食宜清淡，少吃辛辣食物，多吃蔬菜、水果，注意肛周的卫生，保持大便通畅，防止便秘，经常做提肛收缩运动。