大多数根尖周病的患牙，是不需要拔牙的。因为根尖周病是因为牙神经发炎，没有得到及时治疗，炎症通过根尖孔发展到根尖以外造成的病变。对这类根尖周病，只要及时发现，在控制急性炎症以后，通过杀神经，去除坏死神经，进行完善的根管治疗。
通过完善根管治疗以后，可以保证牙根的正常功能。同时，可以通过根尖手术的方式，祛除根尖以外的病变组织和肉芽组织。在进行完善的根管治疗和良好的根尖手术以后，大多数根尖周病的患牙可以得到保留，可以行使良好的咀嚼功能，可以长期使用。
也有个别根尖周病的患牙，因为没有及时发现和得到治疗，最终牙齿破坏的范围比较大，或者根尖周病的范围比较大，最终需要拔除。像这类的拔牙，在拔牙以后强调要对根尖周的病变组织进行彻底搔刮。通过搔刮治疗，彻底祛除周围病变组织，促进骨创面的愈合。只有这样牙槽骨恢复以后，才有可能进行镶牙和种牙的治疗。