乙肝E抗体阴性不好，因为对于乙肝患者乙肝E抗体阴性往往意味着乙肝E抗原阳性。
乙肝表面抗原、乙肝E抗原和乙肝核心抗体，这三者阳性就是大三阳，大三阳患者往往病毒含量高，复制能力强，病毒活跃，通常会伴随着肝脏炎症剧烈、肝脏纤维化的加深。而乙肝E抗体阳性代表病毒复制程度轻，机体对乙肝病毒控制力强。
乙肝E抗原阳性转为乙肝E抗体阳性也是抗病毒治疗的一个重要观察指标，如果乙肝E抗原阳性转变为乙肝E抗体阳性通常代表着目前抗病毒治疗方案效果较好。
综上，乙肝E抗体阴性不好。