蹼状阴茎主要通过手术的方式进行矫正。蹼状阴茎就是指阴囊中线的皮肤与阴茎腹侧的皮肤发生融合，使阴茎包埋于阴囊内，导致患者不能进行正常的性交，也有可能会出现不同程度的阳痿，给患者带来很大痛苦。
在治疗上通过手术将阴囊与阴茎的皮肤横行切开，然后给予纵行缝合，这样可以使阴茎得以外露。对于合并包皮过长、包茎、尿道下裂等其它生殖系统畸形的情况，手术时可以一并予以矫正。
手术过程中止血要彻底，防止术后出现血肿，术后可以应用抗生素一次，预防感染的发生。