新生儿拉稀的时候是可以吃肠道益生菌的。因为孩子之所以出现拉肚子的症状，大多数和肠道的菌群紊乱有关系。可以选择性地给孩子服用肠道益生菌，肠道益生菌具有良好的调节新生儿肠道菌群紊乱的作用，从而改善新生儿拉稀的症状。
另外，建议给孩子吃肠道益生菌的时候，时间不要太长，建议疗程不要超过两周。如果时间太长，会干扰新生儿正常菌群的建立。
另外，如果孩子出现了迁延不愈的拉稀，超过两周孩子拉稀还不见好转的情况下，最好查一下孩子拉稀的原因。可以查便常规，明确有没有肠道感染。如果有肠道感染，要在医生的指导下，合理地服用抗生素药物进行治疗，家长不要随便地给孩子服用药物。