输卵管囊肿需要手术治疗，但并不是绝对的，需要看囊肿的大小。
如果只是小的输卵管囊肿可以暂时不手术治疗，建议定期复查，有慢性炎症时积极治疗即可。但如果囊肿的生长速度快或者是囊肿大就只能通过手术方法治疗，可以在月经干净后3~7天通过开腹或者是腹腔镜手术治疗。
输卵管囊肿可能会导致阴道出血或是影响生育，要根据具体严重程度采取合适方案治疗。若做手术治疗后还要抗炎预防感染，术后注意做好复查，避免过早性生活刺激。