精囊结核在初期的临床症状较轻。主要会引起会阴部不适，并且还有血精。
在性生活时会出现上射精疼痛，精液量也会逐渐减少。在精囊表面会有硬结，但是不会出现压痛。随着感染的持续加重，有可能会引起一些泌尿系统的症状，比如尿液浑浊、排尿疼痛、尿频等。
长期不进行治疗，还有可能会对性功能造成影响，引起性交疼痛、性欲减退、早泄等性功能障碍疾病。在严重时会影响到精子的质量，造成男性不育。因此，在出现精囊结核疾病后，应及时的使用抗结核药物予以治疗，避免精囊结核加重。