动眼神经损伤的临床表现为：该侧眼睑下垂、瞳孔散大、直接与间接光反射减弱或者消失、眼球向内，向上，向下运动受限、眼球固定于外下方，在清醒患者中可有复视。如果伤后出现不规则瞳孔，同时伴有深昏迷或者持续性昏迷，双侧锥体束征，生命体征明显变化，那么需要考虑合并了脑干损伤。
在治疗上，由于动眼神经的再生能力较强，只要动眼神经没有发生断裂，通常在伤后2到3个月内会逐渐恢复。如果伤后6个月没有任何恢复的迹象，那么动眼神经的损伤则可能成为永久性的。