一般肾囊肿并没有明显的症状，所以确诊肾囊肿是需要通过相应的仪器检查来发现的，诊断肾囊肿最简单、最熟悉的方法就是肾脏超声检查，通过超声检查可以发现肾实质内出现圆形或者椭圆形，无回声的区域，囊肿边界清晰、光滑，肾脏的囊肿既可以向外生长，也可以向内挤压肾脏。
另外通过ct检查也可以确诊肾囊肿，典型的肾囊肿ct可以表现为：圆形或者椭圆形的肿物，边缘是光滑的，与肾实质分界清晰，囊内密度比较均匀与水的密度相似。
磁共振成像检查也可以作为肾囊肿的确诊的检查手段，一旦确诊有肾囊肿以后，需要长期观察囊肿大小。