小儿肠炎的预防，要避免接触引起肠炎的致病因素，比如细菌、真菌、病毒等。因为接受放射性治疗，而引起放射性肠炎，在治疗的时候要加强防护措施。
在细菌方面的防控，主要表现在对少儿的饮食餐具、玩具等的彻底消毒，避免进食生冷、不干净的食物，避免因此而引起的细菌性肠炎。积极早期治疗病毒性腮腺炎、上呼吸道感染，才能避免病毒引发肠炎。
平时要注意少儿的营养供给，避免营养不良，导致新陈代谢失调，增强少儿的自身免疫力和抵抗力，都是预防肠炎的措施。