输卵管通水后感染有可能会导致输卵管堵塞。如果输卵管通水没有严格遵守无菌操作或者在通水前没有进行相关检查，忽略了本来就存在的一些阴道炎症，通水就有可能导致宫腔的感染，引起子宫内膜炎。
细菌经子宫内膜上行感染到输卵管，就会引起输卵管黏膜的炎症，导致黏膜粘连、充血、水肿，从而导致输卵管堵塞。也有些会导致输卵管伞端的粘连包裹，形成输卵管卵巢炎，还会形成输卵管卵巢囊肿或者输卵管积水、输卵管积脓等。
所以要进行输卵管通水，首先一定要在月经干净3到7天之内进行。通水前不能有性生活，而且在通水前一定要取阴道分泌物进行化验，要排除阴道以及其他的生殖道炎症才能够通液。而且术中一定要注意无菌操作，这样才能够避免输卵管通水后造成感染的现象出现。