吃巧克力多不会患有巧克力囊肿，巧克力囊肿与吃巧克力多没有明显关系。但是女性大量的吃巧克力可能会对血糖造成影响，增加肥胖的几率。
巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种，与压力过大、内分泌异常、人工流产手术、输卵管通液术，或者是在月经期间进行同房以后导致经血逆流，引起子宫内膜异位到卵巢表面形成的囊肿。
如果巧克力囊肿比较小，而且没有明显的症状出现，多不需要进行特殊处理。如果巧克力囊肿在5cm以上，同时伴有痛经的症状，可以进行腹腔镜手术。