包皮内有小水泡，有下面两种可能：
一种有可能是真菌感染，真菌感染可以引起包皮龟头炎，出现包皮龟头红色丘疹、水泡的情况。可以到医院皮肤科就诊，刮取水泡的泡液，查一下真菌。如果真菌检查阳性 ，局部可以外用抗真菌的药物，如克霉唑乳膏、联苯苄唑乳膏或者特比萘芬乳膏，洗澡的时候可以用碳酸氢钠溶液清洗。
另外，还有可能是病毒感染引起的生殖器疱疹，需要口服无环鸟苷类抗病毒药物，局部外用阿昔洛韦乳膏。同时治疗期间不要有性生活，以免传染给性伴。