输卵管囊肿是能够做试管婴儿的。只是要根据输卵管囊肿的大小，来决定做试管婴儿之前，是否需要将输卵管囊肿进行手术切除。另外，并不是得了输卵管囊肿就要做试管婴儿。
如果只是单纯的输卵管囊肿，而且囊肿比较小，没有其他的不孕因素，实际上并不会影响怀孕，是不需要做试管婴儿的。因为输卵管囊肿绝大多数是一种良性病变，是输卵管系膜的囊肿，是可以自然怀孕的。但是如果输卵管囊肿比较大，也可以首先进行输卵管细膜囊肿的切除，之后再去备孕。因为如果囊肿太大容易发生扭转，会影响输卵管的功能，会导致不孕。
如果存在其他的不孕因素，输卵管本身就存在堵塞或者功能的异常，就可以做试管婴儿。同样的，如果输卵管囊肿比较小，就可以直接做试管婴儿。如果囊肿比较大，建议做试管婴儿之前进行输卵管囊肿的切除。