口腔毛滴虫病目前临床上比较有效的药物就是甲硝唑，又名灭滴灵。
事实上，对于阴道毛滴虫，无论是口腔发生的，还是其他部位发生的，比较有效的药物都是甲硝唑。不过，服用甲硝唑需要确诊以后在医生指导下接受治疗。同时，服用药物一段时间后，需要接受复查，以便观察是否依然还有毛滴虫的存在。
毛滴虫一般寄生在口腔以及齿垢，还有断裂的龋洞中，可以通过人与人之间直接接触、飞沫以及滋养体污染食物等途径传播，需要及早接受治疗。