首先引起慢性腹泻的胃肠道疾病，比如说胃肠道肿瘤严重的肠病，肠易激综合征。功能性腹泻感染性肠结核等等。还有就是一些药物之间的相互作用，也就是说，药源性的。都可以引发慢性腹泻。第二个方面就是肝胆胰腺类的疾病，也可以引起慢性腹泻，包括，肝炎、肝硬化、肝癌、慢性的胰腺炎、胰腺癌还有，可见于胆囊切除术后。再有就是一些全身性的疾病糖尿病、腹泻与胃肠道、植物、神经病变有关。那么甲状腺功能亢进由于肠道蠕动快消化吸收不好出现了大便频繁，甚至腹泻的情况。再有的就是尿毒症。还有自身免疫性疾病，比如说硬皮病等均可引起慢性腹泻。