一部分肛周湿疹患者是由于过敏导致的。从本质上来说，肛周湿疹的发生是由于患者皮肤受刺激，或者是吃了或者是接触过敏的食物、衣物导致的。
直肠脱垂、痔疮和肛瘘这些疾病，非常容易导致肠液，或者是脓性分泌物粘在肛周皮肤上，其中的化学成分对皮肤有刺激性作用，会有瘙痒感。由于部分患者过敏体质，容易对鱼、虾等海鲜，或者是其它的水果有过敏，或者是接触了非棉质的衣服，也会产生过敏，导致湿疹形成。
肛周湿疹非常容易复发，辛辣、刺激食物也容易导致肛周湿疹发生。