由于新生儿脐疝自愈率很高，只要症状不太严重，一般进行保守治疗，主要是做好护理，注意脐部周围的清洁与干燥，避免合并有感染。
如果脐疝比较严重，保守疗法效果不佳，当患儿在两周岁脐疝仍未自愈，可以进行手术治疗，比如腹腔镜下脐疝修补术，创伤小，复发率较低。在必要时还应进行开放性的手术，比如脐环结扎术。如果脐疝较严重，没有及时进行正规治疗，有可能会导致疝囊内容物出现嵌顿，导致部分肠道缺血坏死，从而严重影响到小儿的身体健康。
因此，新生儿脐疝要尽早地进行治疗，避免加重。