利用131碘来治疗甲亢导致发生甲减的概率会非常的高。因为131碘治疗甲亢后发生甲减是与患者对于射线的个体敏感性高和自身的免疫功能紊乱有关系，在目前没有任何有效的预防措施。
如果要是使用131碘的剂量低一些，仅仅能够降低早发性的加减，对于晚发性的甲减，没有任何的阻止作用。
因此大多数的医生都会选择较高活度的131碘来治疗甲亢，提高一次的治愈率。尽管这样早发性的甲减的发生率会增高，但是甲减可以通过口服甲状腺素片来获得控制。