治疗脑梗塞最好的药物是溶栓药物，发病后3-4小时时间窗内可用阿替普酶溶栓，这是目前公认最好的治疗脑梗塞的药，疗效好、副作用小。
很多病人就诊时身体半边手足不能动弹、说不出话、甚至神智不清，溶栓后半个小时或一小时恢复到发病前状态。
如果过了时间窗，溶栓药没有用药指征，可以给予阿司匹林、波立维抗血小板集聚，他汀类药物稳定血管内皮细胞、稳定斑块。
一般建议患者怀疑有脑梗塞时尽早就医，不要错过溶栓时间窗，其它药物如依达拉奉清除氧自由基、胞二磷胆碱脑保护药，甚至一些中药都是辅助治疗药物。