小便隐隐刺痛不适的常见原因是损伤、感染、上火。房事后发生的隐隐刺痛不适，要考虑性过程中导致尿道口摩擦损伤所致，暂停性生活安排，观察等待损伤修复后，症状即可消失。大肠杆菌入侵尿道，导致尿道炎，小便对炎性充血的尿道黏膜刺激，而有排尿不适感觉。
不洁性行为后发生的不适症状，还需要考虑性疾病，可辅助尿液化验、尿道口取分泌物涂片化验检查，明确致病菌。过多量辣椒等刺激食物后上火，尿道黏膜充血，也可发生尿刺痛感觉，忌口辣椒以及饮酒等刺激食物，而使症状得到改善。