产碱杆菌肺炎的治疗，需要吃抗生素以及对症的解热镇痛和化痰的药物，一般常用的抗生素就是第三代的头孢类以及氨基糖苷类的抗生素。
第三代的头孢类常用的有头孢哌酮钠、头孢他啶等，这一类的药物可以彻底的清除产碱杆菌，主要用于没有过敏以及凝血功能障碍的人。
氨基糖苷类抗生素常用的有庆大霉素、卡那霉素等，而这类的药物可以阻碍细菌合成蛋白质从而发挥作用，它适用于没有过敏以及没有肾脏疾病的人。如果患者有发热、胸痛以及咳痰剧烈的情况，可以用布洛芬这种解热镇痛药以及氨溴索这种化痰药。