一般情况下孩子发烧三十九度不会烧坏脑子。
孩子发烧大都是由于机体受到病毒、细菌、支原体、衣原体等致病菌感染，导致体内发生炎症反应从而引起发烧。只要积极去医院就诊，通过相应的抗炎药物治疗，去除原发病以后基本上都会恢复正常。
但是如果孩子发烧是由于颅内感染、肿瘤等疾病所致，并一直处于高热状态有可能会烧坏脑子。因为孩子的神经系统发育还不是很完善，长期的高热会刺激到大脑神经功能使其受损。
因此当孩子出现这种情况的时候，及时去医院就诊，听从医生指导并配合治疗，绝大多数不会出现烧坏现象。