甲状腺检查指标分析中常见的有TT3、TT4，这是总三碘甲状腺原氨酸和总甲状腺素的指标，它的升高提示甲亢的可能，它的降低提示甲减的可能，也有可能是低T3综合征，总T3、总T4受甲状腺结合球蛋白的影响。
第二个是FT3、FT4，这个是游离三碘甲状腺原氨酸和游离甲状腺激素，升高和降低的意义同TT3和TT4是相同的，但是它的化验不受甲状腺结合球蛋白的影响。TSH也叫促甲状腺激素，是甲状腺检查指标当中比较敏感的一个指标，TSH升高提示原发性甲状腺功能减退症的可能或者是垂体性甲亢的可能，TSH下降提示原发性甲状腺功能亢进症或者是垂体性甲减的可能。
另外目前常常化验的还有TPOAB和TGAB，这两个化验指标升高提示桥本氏甲状腺炎的可能。还有一个TRAB促甲状腺激素受体抗体，是用来诊断GRAVES病的一个指标，它的升高提示GRAVES病甲亢的可能性比较大。