对于输尿管结石微创手术主要有两类，一是输尿管镜钬激光碎石，二是腹腔镜下输尿管切开取石。对于输尿管镜钬激光碎石主要是患者在麻醉之后取截石位，然后医生将输尿管镜通过尿道外口进入到尿道、膀胱，然后进入到输尿管，从而继续上行找到输尿管内部的结石，然后进行钬激光碎石，在碎石手术之后需要留置输尿管支架管，同时留置导尿管。患者在麻醉清醒之后可以早期下床活动，同时多喝水勤排尿，一个月之后去泌尿外科复查，拔除输尿管支架管即可。同时患者需要每半年去泌尿外科进行复查，防止输尿管狭窄引起肾盂积水。
对于腹腔镜下输尿管切开取石，一般术后复查同输尿管镜碎石是一样的，只是手术方式有所区别。输尿管镜钬激光碎石主要是在腔内进行，而腹腔镜下输尿管切开取石是在腹腔内进行找到结石的位置，然后切开输尿管，将结石取出再将输尿管缝合。