主要方法是手术，近10余年来由于高敏感度放免测定β-hCG及高分辨B超和腹腔镜的开展。异位妊娠早期诊断率显著提高，因此临床上采用保守手术及药物治疗机会大大提高。
1.手术疗法（1）输卵管切除术 无论是流产型或破裂型输卵管妊娠。输卵管切除可及时止血，挽救生命。在已有子女不再准备生育的妇女，可同时行对侧输卵管结扎。在需要保留生育能力的妇女，如果输卵管病灶太大，破口太长，损及输卵管系膜及血管和（或）生命指征处于严重状态时亦应作输卵管切除。在行保守性手术中，输卵管出血无法控制应当立即切除输卵管。（2）保守性手术 原则上是去除输卵管妊娠物，尽可能保留输卵管的解剖与功能，为日后宫内妊娠创造条件。年轻女本次输卵管妊娠为首次妊娠；无子女已经切除一侧输卵管。应做输卵管切开清除胚胎术。
各种手术的术式均可采用腹腔镜和开腹手术两种方式。开腹手术较为直观，可在直视下进行上述操作，而腹腔镜则创伤较小，但需要相关设备和操作人员的熟练技术。
2.药物治疗 甲氨蝶呤主要是用于输卵管妊娠未破裂型，输卵管浆膜完整，没有活动性出血，输卵管妊娠产物处直径<3～4cm，腹腔中血液<100ml，β-hCG