治疗脑栓塞的药物方面主要包括以下几种：
一、抗凝药。如果患者没有抗凝治疗的禁忌证，应早期地进行抗凝治疗，并通过血常规、凝血项等方面进行定期的复诊，常用的抗凝药主要包括华法林等。
二、抗动脉硬化。脑栓塞的患者同时会伴有严重的动脉硬化，常用的药物主要为他汀类的药物，例如辛伐他汀等。
三、慢性病的治疗。如果伴有慢性疾病的，应积极地治疗慢性病，把血压、血脂、血糖等方面调整到合理的范围之内。
四、脑保护治疗，主要减轻脑梗后自由基损伤。