特发性皮肤钙化病的治疗方式，根据其疾病的类型有所不同：
1.全身性钙沉着症是指钙沉积在真皮、皮下组织和肌肉内，与任何已知的组织损伤或代谢疾病无关。其治疗可选用磷酸纤维素加低钙治疗。疼痛性皮疹手术切除能获暂时性改善，对某些患者可选用糖皮质激素，但疗效还不确切。
2.表皮钙化结节及特发性阴囊钙化沉着症的治疗均无特殊方法，也可以选择手术切除。
3.粟粒样特发性皮肤钙化沉着症在成年后可自行消退，一般不留瘢痕。
4.肿瘤性钙化可选择口服氢氧化铝及低钙、低磷饮食，会有改善。治疗主要是手术切除，切除不完全易复发。