先天性心脏病本身不会导致发烧，但是如果体内出现了感染，就可以引起发烧。这种感染可以发生在身体多个部位，包括呼吸系统的感染，特别是支气管的炎症、肺部的感染，也可以使心内膜炎，或者消化道、泌尿系统的感染都可以导致体温升高。但是这种发烧并不是先天性心脏病直接导致的，而是由于体内的细菌，或者病毒等微生物感染引起的。
一旦出现发烧，需要及时化验血常规、尿常规，做胸片检查，明确感染的部位，尽早选择合适的抗菌素，或者抗病毒药物控制感染，炎症控制以后，体温就会恢复正常。
如果是发生了心内膜炎，这种情况抗感染的时间要适当延长，大约在4~8周才可以达到彻底控制的效果。