对于妊娠合并生殖器疱疹病毒的孕妇，通常都可以考虑使用阿昔洛韦来进行治疗，必要的时候还可以使用阿昔洛韦软膏在外阴局部进行涂抹，只是局部用药，较口服用药疗效差，而且可能会诱导耐药，所以不常规推荐使用。
即使女性是在怀孕早期，都需要考虑应用阿昔洛韦来进行治疗，这样可以减少病毒的排放，控制其传染性。
对于软产道有活动性疱疹病变的孕妇，在没有胎儿畸形也没有破膜的情况下，可能需要考虑行剖宫产手术来终止妊娠，以免在阴道顺产分娩的过程中而导致疱疹病毒感染到胎儿，出现新生儿的并发症。