肾小盏形态失常往往和肾积水有关，其治疗就是要针对肾积水进行。肾小盏形态失常可以表现为扩张或者变钝，实际就是出现了肾积水。根据肾积水的严重程度不同，采用不同的治疗策略。
轻微的肾积水可以药物治疗，常见的有溶石以及抗生素等。抗生素可以对症缓解感染引起的肾积水，有疼痛现象可以服用哌替啶等止痛药物。
严重患者则需要手术，该病的治疗效果一般很好，基本可以痊愈。如果出现尿毒症等并发症则不能治好，一定要及时复查。