嘴上长水泡的处理方式，主要是根据水疱的大小，以及水疱的具体疾病原因进行对症治疗。
如果这种水疱较大，并且张力比较明显，不管是哪一种疾病导致，都可以采取消毒针挑破，然后局部外涂碘伏治疗。这样能够防止后续形成的继发细菌感染等。如果这种水疱并不大，比如形成了病毒感染造成的单纯疱疹，一般可以直接地外涂阿昔洛韦软膏或者是喷昔洛韦乳膏等。
如果这种水泡是由于细菌感染而导致的脓疱疮，一般可以直接外涂氧化锌乳膏和莫匹罗星乳膏，这样能够促进局部渗出的缓解，同时也要进行抗感染治疗。