在临床上面肾囊肿分为三种情况，
第一种就是单纯性的肾囊肿，
第二种就是多囊肾，
第三种就是获得性的肾囊肿。
导致这三种肾囊肿的原因并不相同，单纯性肾囊肿发生的原因不是非常的明确，可能是与年龄有一定的关系，年龄增大以后引起肾小管憩室增加并形成囊肿。多囊肾发生的原因是与患者基因出现突变有关系，这是一种属于遗传性的疾病。
后天性肾囊肿主要多见于进行血液透析的患者，长期血液透析接触透析器、血路管等，这些材料含有增塑剂可以刺激肾小管出现囊肿，其中多囊肾是最严重的，而且需要更积极的进行治疗。