常见的并发症有：
第一、上消化道出血。反流性食管炎患者因食管粘膜炎症糜烂及溃疡可以导致上消化道出血，临床表现有呕血、黑变以及不同程度缺铁性贫血。
第二、食管狭窄：反复发作的食管炎致使纤维组织增生，是严重食管炎的表现；
第三、Barrett食管：在食管粘膜修复过程中，食管贲门交界处的齿状线2cm以上的食管鳞状上皮被特殊的柱状上皮取代称为Barrett食管。Barrett食管发生溃疡时又称为Barrett溃疡。Barrett食管是食管腺癌的主要癌前病变，其腺癌的发生率较正常人高30-50倍。