对于巧克力囊肿的女性，怀孕的几率一般都不是特别大的。因为巧囊在出现以后，会导致卵巢输卵管局部出现粘连，所以就会影响女性的怀孕。
很多巧克力囊肿的女性都会合并有不孕症的出现。只是对于巧克力囊肿比较小，而且出现时间比较短的女性，怀孕的几率就会相对比较高。
所以如果女性在发现巧克力囊肿以后，巧克力囊肿包块已经特别大，常常就需要尽快的做腹腔镜手术。将巧克力囊肿切除以后，再肌注亮丙瑞林来进行巩固治疗，停止用药以后再进行备孕、怀孕。