滴虫性尿道炎一般都会合并有滴虫性阴道炎，它是由阴道毛滴虫引起的常见的阴道炎症，也是常见的性传播疾病。
滴虫性尿道炎和滴虫性阴道炎，往往潜伏期在4天到28天，百分之50的患者在感染初期没有临床症状，主要的症状是阴道分泌物增多和外阴瘙痒，会出现灼热、疼痛和性交痛。
分泌物的典型特点是稀薄脓性、泡沫状、有异味，分泌物呈灰黄色、黄色，脓性是由于其中含有大量的白细胞。
如果合并其他的感染，则呈现黄绿色，呈泡沫状和有异味的分泌物，是滴虫无氧酵解碳水化合物产生腐臭气体所致。如果合并有尿道感染，会出现有尿频、尿痛、尿急等等的临床症状，有时会出现血尿。