脐尿管囊肿可以通过手术的方法进行治疗，因为几乎口服药物没有效果，而且引流是个不错的方法。
做完手术之后，如果还有硬块儿，就需要进一步的进行检查，可以通过彩超或者是注入相应的药物，以观察是否已经将脐尿管囊肿完全的去除。
这种疾病目前还是以手术治疗为主，由于脐尿管囊肿有可能会并发脐尿管漏，所以一定要尽可能的将囊肿引流干净，否则反复出现囊肿就有可能并发进一步的疾病，甚至于出现化脓性的感染，严重时甚至出现脐尿管癌的可能。