羊水三度污染对胎儿有影响，比如吸入性肺炎、羊水咽下综合征等。
羊水三度污染时无论是经阴顺产分娩还是剖宫产，在胎儿出生哭出来的那一刻，均会有不定量的羊水进入新生儿肺内。三度污染的羊水会刺激肺部出现炎性反应，导致吸入性肺炎。严重的还会造成新生儿肺动脉高压，影响动脉导管闭合等。
新生儿在宫内存在吞咽羊水的情况，羊水三度污染时，吞咽进胃部的羊水刺激胃黏膜出现呕吐症状，影响新生儿出生后进奶等。
羊水污染是胎儿胎粪进入羊水所致，多是因为胎儿缺氧后肛门松弛的后果，提示宫内缺氧。新生儿出生后要严密观察反应、反射等。缺氧严重的要及时治疗。