对于更年期肛门瘙痒，其治疗首先应该去除可能引起或者加剧本病的病因，让患者尽量避免搔抓和局部刺激，局部外用止痒剂。对于其吃什么药主要是指全身治疗。瘙痒剧烈可以口服止痒药物，比如异丙嗪、氯雷他定、阿司咪唑。更年期和老年患者还可以应用性激素，如果男性患者，可以用丙酸睾酮25毫克，肌内注射，每周两次；或者服用甲基睾酮5毫克，一日两次。女性患者可以服用乙烯雌酚0.5毫克，每日两次。也可配合维生素B2、维生素C、维生素A进行治疗。